L’archipel indonésien des Raja Ampat (« les quatre rois ») est situé près de la côte nord-ouest de la Nouvelle-Guinée. Il est constitué de quelque 1 500 îles, souvent montagneuses, dont les plus grandes sont Waigeo, Batanta, Salawati et Misool. La superficie totale de l’archipel est d’environ 46 000 km2.
L’archipel est situé à la limite occidentale de l’océan Pacifique et, à son niveau, se rencontrent les eaux des océans Pacifique et Indien, ce qui donne naissance à un fort courant et des marées puissantes si bien que les eaux sont souvent agitées.
Les récifs de Raja Ampat font partie du Triangle de Corail entre l’Indonésie, les Philippines et la Nouvelle Guinée. Ils sont particulièrement intéressants car non seulement ils sont en parfait état, mais ils concentrent une exceptionnelle biodiversité. L’UNESCO envisage de mettre les îles Raja Ampat sur sa liste du patrimoine mondial comme zone ayant la plus riche biodiversité marine de notre planète.
En 2007, le gouvernement indonésien a désigné sept nouvelles zones marines protégées couvrant 9 000 km².